在深圳，从事电商类小程序的运营是否需要申请EDI许可证（在线数据处理与交易处理业务许可证）取决于小程序的具体功能和业务模式。以下从法律规定和实际操作角度进行解析：  

一、电商小程序是否需要EDI许可证？  

       EDI许可证适用于提供在线数据处理与交易处理业务的企业，尤其是涉及第三方平台交易撮合的业务场景。以下是具体判断依据：  

       需要EDI许可证的情况：  
       1. 平台模式：  
                 小程序作为第三方交易平台，供多个卖家与买家进行交易撮合。例如：类似京东、淘宝模式的电商平台。  

       2. 交易撮合服务：  
                 小程序提供在线交易、支付结算、订单处理等服务，涉及直接参与交易行为。  

       3. 面向公众开放：  
                 平台非企业自营，而是面向多方用户开放，允许多个商户入驻并开展交易业务。  

       不需要EDI许可证的情况：  
       1. 自营电商模式：  
                 小程序仅用于企业自有商品或服务的展示和销售，不涉及第三方交易撮合。  

       2. 信息展示模式：  
                 小程序只提供商品或服务的展示和简单链接功能，实际交易在其他平台（如支付宝、微信支付）完成。  

       3. 无支付功能：  
                 如果小程序不具备在线支付结算功能，仅作为一个导流工具，则不需要EDI许可证。  

二、申请EDI许可证的条件和流程  

       申请条件：  
       1. 企业主体要求  
                 - 必须是依法设立的内资企业；  
                 - 注册资本不少于100万元；  
                 - 企业有固定的办公场所和符合要求的技术团队。  

       2. 业务合规要求  
                 - 网站（或小程序）具备完整的交易流程功能，包括交易撮合、支付结算等；  
                 - 网站内容符合国家法律法规要求，无违法违规信息。  

       3. 其他要求  
                 - 已完成ICP备案；  
                 - 数据中心或服务器需托管在中国大陆境内。  

       申请流程：  
       1. 材料准备  
                 - 营业执照副本复印件；  
                 - 法定代表人身份证明；  
                 - 企业经营计划书；  
                 - 域名备案证明；  
                 - 服务器托管证明。  

       2. 递交申请  
                 向深圳市通信管理局递交申请材料，确保内容完整无误。  

       3. 审核与整改  
                 申请后，相关部门会审核企业资质，可能要求补充或调整材料。  

       4. 发证  
                 审核通过后发放EDI许可证，有效期为5年，需按期年检或续期。  

三、EDI许可证办理难点与解决方案  

       1. 难点：材料准备复杂  
                 企业需要提供技术报告、测试结果等专业材料，许多企业因不熟悉要求导致申请被驳回。  
                 解决方案：建议寻求专业代办服务，确保材料合规和齐全。  

       2. 难点：业务模式审核严格  
                 如果企业业务模式存在合规风险，如虚假交易或数据安全问题，容易被驳回。  
                 解决方案：聘请专业顾问进行合规性审核，确保业务符合政策规定。  

       3. 难点：流程较长  
                 审批周期较长，若有材料不合格可能多次返工，影响业务上线时间。  
                 解决方案：提前规划时间表，材料准备阶段可同步进行业务筹备。  

四、深圳电商小程序企业的建议  

       1. 判断业务模式：  
                 确定是否为第三方交易撮合平台。如果属于，则需要办理EDI许可证；否则，可先行备案并运营。  

       2. 咨询专业机构：  
                 如果企业对资质申请流程不熟悉，可咨询代办机构（如中企百通）协助办理，节省时间和成本。  

       3. 业务上线前准备：  
                 提前完成ICP备案、支付接口接入等基础工作，以保证小程序功能符合监管要求。  

       通过以上分析，深圳电商小程序是否需要EDI许可证取决于其具体业务模式。企业应根据实际情况合理规划资质办理流程，确保合规运营。