是的，深圳电商小程序若涉及在线交易和支付功能，则需要申请EDI许可证（在线数据处理与交易处理业务经营许可证）。以下是详细说明：  

一、为什么电商小程序需要EDI许可证？  
       EDI许可证适用于开展在线数据处理和交易处理业务的企业，具体包括以下场景：  
              1. 在线交易服务：用户通过小程序完成商品或服务的购买。  
              2. 支付结算功能：小程序内集成支付接口（如微信支付、支付宝）。  
              3. 订单管理：通过小程序实现订单生成和管理功能。  

       若您的电商小程序包含上述任一功能，都需办理EDI许可证以符合法律规定。

二、申请EDI许可证的条件  
       1. 企业资质  
                 - 企业必须为内资公司，外资比例不得超过50%；  
                 - 注册资金不少于100万元。  
       2. 业务规范  
                 - 符合《电信条例》和《互联网信息服务管理办法》要求；  
                 - 小程序内容及交易模式合法合规。  
       3. 技术能力  
                 - 拥有稳定的技术团队和运行保障措施；  
                 - 提供小程序后台系统和支付接口的相关说明。  
       4. 域名备案  
                 - 小程序的关联域名必须完成ICP备案。  

三、申请流程  

       1. 前期准备  
              - 材料清单：  
                - 公司营业执照副本；  
                - 公司法定代表人身份证明；  
                - 公司股东及股权结构证明；  
                - 域名备案证明；  
                - 商业计划书及业务模式说明。  
              - 检查合规性：确保交易流程、用户隐私?；さ确矫娣瞎娑ā? 

       2. 提交申请  
              - 登陆深圳市通信管理局官网或线下窗口提交材料。  

       3. 审核及反馈  
              - 通信管理局审核材料并提出修改意见（若有）。  
              - 审核通过后，企业获得EDI许可证，期限为5年。  

四、电商小程序办理EDI许可证的难点与建议  

       1. 业务模式合规性  
              难点：部分企业因业务涉及第三方支付或虚拟物品交易而被拒。  
              建议：确保业务流程合法，涉及支付结算时严格遵循监管要求。  

       2. 技术方案复杂  
              难点：需提交详尽的技术运行方案，如支付接口对接、数据安全方案。  
              建议：与技术团队或第三方服务提供商沟通，确保方案清晰。  

       3. 材料不全或不规范  
              难点：部分企业因未能提供完整的备案证明或商业计划书而被驳回。  
              建议：根据材料清单提前整理，必要时咨询代办服务机构（如中企百通）。  

五、常见问题解答  

       1. 问：个人开发的小程序需要EDI许可证吗？  
                 答：个人开发的小程序无法申请EDI许可证，需以公司名义申请并上线。  

       2. 问：EDI许可证和ICP许可证有什么区别？  
                 答：ICP许可证适用于所有经营性网站，而EDI许可证专门针对在线交易处理业务，通常两者可以一起申请。  

       3. 问：不申请EDI许可证可以上线电商小程序吗？  
                 答：未经许可运营在线交易业务属于违法行为，可能被?？罨蚬乇辗瘛? 

       4. 问：外资企业能申请EDI许可证吗？  
                 答：可以，但外资比例不得超过50%，需向工业和信息化部递交申请。  

       通过以上信息，深圳电商小程序运营者可以有针对性地规划EDI许可证申请流程，确保小程序合法上线运营。